GİS · Örnekleme · Moleküler
Pankreas EUS biyopsisinde DNA yeterli, RNA yetersiz: yanlış negatif füzyon tuzağı
Pancreatic EUS biopsy: discordant DNA and RNA sequencing adequacy
Aynı küçük biyopside DNA-NGS çalışabilirken RNA füzyon analizi kalite kontrolünden geçmeyebilir; teknik başarısızlık gerçek negatiflik değildir.
Bilimsel içerik sorumlusu: Prof. Dr. İbrahim Metin Çiriş · Son güncelleme:
Neden Yanıltır?
- Tümör yüzdesinin yeterli olması, RNA bütünlüğünün yeterli olduğu anlamına gelmez.
- DNA analizi tamamlandığında bütün moleküler testler tamamlandı sanılabilir.
Ayırıcı Tanı İpuçları
- DNA ve RNA kalite kontrol raporlarını ayrı inceleyin.
- FFPE fiksasyon, nekroz, düşük hücre sayısı ve panel kapsamını değerlendirin.
Minimal Çalışma
- H&E üzerinde tümör oranı ve doku rezervi kontrolü.
- RNA yetersizse kalan doku, alternatif blok veya yeniden örnekleme seçeneğini klinik ekiple değerlendirin.
Raporlama Yaklaşımı
- “Füzyon saptanmadı” yerine, geçersiz analizde “RNA füzyon analizi teknik nedenlerle değerlendirilemedi” deyin.
Olgu Başı Hızlı Kontrol Listesi
- RNA QC gerçekten başarılı mı?
- Füzyon panel kapsamı uygun mu?
- Alternatif materyal var mı?
Konuyla İlgili Blog Yazıları
Tüm patoloji blog yazıları →Aynı Alanın Diğer Tanı Tuzakları
Eğitim amaçlıdır. Güncel sınıflama ve olguya özgü değerlendirme gerekir.