2026 OncoKB Güncellemeleri: NGS Panelimizde Neler Değişti?

Kullandığımız 679 DNA + 80 RNA genlik kapsamlı NGS paneli, 2026 yılı içinde yayımlanan OncoKB güncellemeleri açısından yeniden değerlendirildi.

Sonuç olarak panelin fiziksel/gen içeriğinde değişiklik gerektiren belirgin bir eksiklik saptanmadı. Ancak varyantların onkojenite ve klinik aksiyonabilite yorumunu etkileyebilecek önemli OncoKB değişiklikleri mevcut.

🔥 Yeni hotspotlar

OncoKB v7.5 ile toplam 164 yeni kanser hotspotu tanımlandı.

• Bunların 162'si kullandığımız panel kapsamındaki genlerde
• Yalnızca RRAS2 G23 ve G24 panel dışında
• Toplam 52 panel geninde yeni hotspot bilgisi bulunuyor

Özellikle PIK3CA, PTEN, STK11, SPOP, SMAD4, SMARCA4, AKT1, ATM, BRAF, CDH1 ve benzeri genlerde daha önce nadir/VUS olarak değerlendirilebilecek bazı varyantlar için yeni hotspot kanıtı ortaya çıkmış durumda.

Önemli: hotspot = oncogenic şeklinde otomatik bir kabul yapılmamalıdır.
Hotspot bilgisi ek kanıt olarak kullanılmalı, nihai sınıflama güncel OncoKB oncogenic sonucu ve diğer fonksiyonel/klinik verilerle birlikte yapılmalıdır.

🎯 Klinik aksiyonabilite değişiklikleri

ERBB2 – NSCLC

Önceden geniş biçimde kullanılan:

ERBB2 oncogenic mutation → Level 1

yaklaşımı artık yeterli değil.

NSCLC'de Level 1 kapsamı esas olarak:

• oncogenic missense varyantlar
• exon 20, 770–831 in-frame insertions

ile sınırlandırıldı.

Bu nedenle ERBB2 fusion, farklı bölgelerdeki in-frame insersiyonlar veya diğer oncogenic ERBB2 değişiklikleri otomatik olarak Level 1 kabul edilmemeli.

Hematolojik maligniteler

OncoKB v7.4 ile hematolojik tümörlerde Level 3B propagation yaklaşımı genişletildi.

Bir hematolojik malignitede Level 1/2/3A olan bir biyobelirteç, aksi yönde spesifik veri yoksa diğer hematolojik neoplazilerde Level 3B olarak değerlendirilebiliyor.

Bu değişiklik özellikle:

IDH1 / IDH2 / FLT3 / BTK / ABL1

gibi genlerde raporlama otomasyonunu etkileyebilir.

🧩 Diğer önemli genler

2026 güncellemelerinde raporlamayı doğrudan etkileyebilecek değişiklik bulunan panel genleri arasında:

ESR1, NRG1, NTRK1, PTEN, IDH1, IDH2, BTK, ALK, EGFR, MET, RET, FLT3, ABL1

yer alıyor.

Ayrıca bazı genlerin oncogene / tumor suppressor gene sınıflamalarında da değişiklikler mevcut.

⚙️ NGS yorumlama motorunda yapılması gerekenler

• OncoKB dataVersion ve apiVersion rapor/log içine kaydedilmeli
• oncogenicity ve actionability birbirinden bağımsız tutulmalı
• Hotspot bilgisi doğrudan patojenite/oncogenicity sonucu olarak kullanılmamalı
• ERBB2 için varyant tipi ve lokalizasyonu ayrıca kontrol edilmeli
• Hematolojik Level 3B propagation kuralları gözden geçirilmeli
• Statik varyant listeleri yerine mümkün olduğunca güncel OncoKB API kullanılmalı
• Europe PMC sorgularında yalnızca HTTP 200 yeterli kabul edilmemeli; boş/eksik yanıtlar ayrıca kontrol edilmeli

📌 Sonuç

Panel kapsamımız güncel moleküler onkoloji pratiği açısından halen oldukça geniş ve yeterli görünüyor.

2026'daki temel değişiklik yeni gen eklenmesi ihtiyacından çok, mevcut panelde yakaladığımız varyantların nasıl yorumlandığının değişmesi.

Bu nedenle önceliğimiz paneli değiştirmek değil; OncoKB tabanlı varyant yorumlama ve raporlama otomasyonunu güncel kurallarla senkronize etmek olmalıdır.